馬的遺傳對馬的後天能力影響較大，在當今賽馬世界裡面，有兩個血統理論存在分歧。

一種叫頂線理論，從父系追查的馬的血統；另外一種是底線理論，從母系追查馬的血統和來源。

其中，頂線理論的人認為，父系對馬的後天能力影響比較大，有一匹馬叫“北方舞者”，其後代有三屆打吡冠軍，這一實例從而很好地印證了頂線理論的說法。

底線理論則認為，母系對其影響大，小馬駒出生以後，和母馬一起生長，母馬的動作、習慣等方面會影響後代，說明母系對後代影響大。

雙方各執己見，各自都有道理，但是陳彼德認為研究馬的血統，應該綜合分析，父母系對馬都有影響。父系影響馬的特點、性能。而母系影響到馬的跑步姿勢。

而香港著名馬主周永健則在接受第一賽馬網采訪時說道：“我自己挑選馬匹時會用很多數據和方法，全部綜合起來再平衡風險。在這個過程中，我最注重的是馬匹母親，而不是馬匹父親，配種出“快如疾風”的母親是我經過很詳細的考慮，找了很久才找到的！”

為什麼馬匹母親賽馬成績對後代影響這麼大？周永健認為有好幾個原因：

1.線粒體染色體基因（Mitochonrial DNA)是母親遺存的，就是我覺得母尾線是馬匹血統裡面最重要的！

2. X factor，即馬匹心髒大小也是母線遺存的，最起碼大家一直以來都是這樣認為，但是現在最新科學研究說，也許Y染色體也有會影響到X染色體對心髒大小發展和影響。

3.Rasmussen Factor，之前有研究就是近親交配，特別是用優秀的馬匹母親，對後代成績有顯著影響，這種研究，應該說數據分析被多次重復，效果有的研究說顯著，有的研究說沒有跟正常有多分別，但是我自己認為是明顯有的，我會之後拿出數據和理由，來跟大家分析，這是對配種學和配種分析一門很重要的環節！

最後我想說如果馬匹母親沒有成績，不要說賽跑贏不了，即使連跑位置都不能，也可以當馬匹母親來配種，我自己也有完全‘沒用’的馬匹母親用來配種，當然要有其他充分的原因和理由，因為數據上是吃虧的，但是不要忘記歷史上很多完全賽跑成績不行的馬匹母親，也成為歷史最成功配種的馬匹母親，舉例子，新西蘭的Eight Carat，好像跑六次，五次跑最後（不完全肯定），她的後代卻贏了22場一級賽，是近50年新西蘭最出名的馬匹母親，因為我很注重母尾線，我自己也收鑼了之前提及的The Centenary也是Eight Carat母尾線的(剛剛8月27日再贏了！)是我將來配種的重要馬匹母親，希望她可以配種前贏到級賽，而且再配種出些級賽子女！

當然馬匹父親的後代市場回報最好，比如大家談到“天價”周歲馬，都是說爸爸是誰，往往因為市場帶著很多標榜，種公馬的配種能力和配種價錢會被不成比例地叫高很多。“好”的公馬通常是與成績最優秀的母馬交配的，所以成績是受馬匹父親影響或是受馬匹母親影響就模糊了！

 

來源：第一賽馬網